31 жовтня 1517 року він опублікував свої «95 тез», критикуючи папські зловживання та продаж індульгенцій. Лютер прийшов до переконання, що християни спасаються через віру, а не через власні зусилля. Це настроїло його проти багатьох основних вчень католицької церкви.
Католики стверджують, що той, хто стверджує, що отримав доручення від Бога відкрити Христа дегенеративному світу, повинен сам вести життя, подібне до Христа. Але Лютер цього не зробив; і неможливо уявити, щоб такий тип людини, як він, був обраний Богом для реформування Церкви Христової.
На відміну від Римо-католицької церкви, Лютерани не вірять в посаду папства як така має будь-який божественний авторитет або що християни повинні підкорятися владі Папи, щоб бути «справжніми» членами видимої церкви. Розбіжності залишаються як щодо кількості, так і щодо характеру таїнств.
Лютер відкинув кілька вчень і практик Римсько-католицької церкви. Він рішуче заперечував твердження, що свободу від Божої кари за гріх можна купити за гроші, запропонувавши наукове обговорення практики та ефективності індульгенцій у своїх Дев’яносто п’яти тезах 1517 року.
Однією з проблем, яка розділила протестантів і католиків під час Реформації, була розбіжності щодо того, чи досягають християни спасіння на небі лише через віру в Бога чи через поєднання віри та добрих справ.
У ньому детально описано спротив Лютера тому, що він вважав зловживанням Католицької Церкви та розбещенням католицьким духовенством, яке було продаж повних індульгенцій, які були свідоцтвами, які мали зменшити дочасне покарання в чистилищі за гріхи, вчинені покупцями або їхніми близькими.