Рис. 1: Принцип індукованих арабінозою ATF, встановлених у цьому дослідженні. стан індуктора вимкнено: За відсутності арабінози димер AraC зв’язується з O2 і я1 напівсайти, спричиняючи зациклення ДНК, що перешкоджає доступу РНКП до промотору. В результаті АТФ не виявляється.3 окт 2023
У присутності арабінози, арабіноза зв’язується з ділянками зв’язування арабінози AraC, спричиняючи димеризацію AraC на операторах I1 та I2. Це дає доступ CAP для зв’язування з CAP-зв’язуючими сайтами, що, у свою чергу, допомагає залучити РНК-полімеразу до промоторів PBAD і PC та активує транскрипцію.
Ця петля обмежує білок AraC, зв’язаний з araI, від переходу в стан індукції та утримує неіндукований рівень експресії PBAD на низькому рівні. При додаванні арабінози відкривається петля araO2-araI, і арабіноза, зв’язана з білком AraC на ділянці araI, переводить AraC у індукуючу конформацію, тим самим індукуючи PBAD.
Індуцибельний промотор Це потужний регуляторний промотор, який допомагає в ефективній експресії бажаного гена. Регуляторні промотори активуються лише тоді, коли вони отримують специфічний стимул. Після активації вони зв'язуються з РНК-полімеразою і факторами транскрипції. Таким чином, починається процес транскрипції.
У цій системі гени, що кодують транспортери арабінози (araE і araFGH) і катаболічні гени арабінози (araBAD), знаходяться під індукованим арабінозою контролем через AraC; арабіноза зв'язується з білком AraC, який позитивно регулює експресію транспортерів і негативно регулює власну експресію (Мал.
Індукція арабінози здійснюється при кінцевій концентрації 2-6 г/л, тоді як індукція IPTG здійснюється при кінцевій концентрації 0,12-0,24 г/л. Використання арабінози також має переваги. Індукцію арабінози можна титрувати, тобто чим вища концентрація арабінози, тим сильніша експресія.