Амплікони є ДНК-продукти полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР). Термін амплікон часто використовується як синонім із продуктом ПЛР. Високопродуктивне секвенування, яке також називають секвенуванням наступного покоління (NGS), можна використовувати для отримання послідовності фрагмента ПЛР, націленого на певну геномну область.
Праймери — це невеликі олігонуклеотиди ДНК, які спеціально розроблені для націлювання лише на гени/регіони інтересу. Коли відбувається ампліфікаційна частина ПЛР, розмножуються лише ці специфічні гени. Кінцеві продукти ПЛР називаються ампліконами, отже секвенування ампліконів [1].
Націлюючись і ампліфікуючи точні ділянки ДНК, дослідники можуть використовувати амплікони виділяти та вивчати гени, які відповідають за захворювання, а також відстежувати генетичні варіації в популяціях. Вони навіть можуть ідентифікувати людей на основі їхніх унікальних генетичних маркерів.
Переваги секвенування ампліконів Знижує витрати на послідовність і час виконання в порівнянні з іншими підходами, як WGS. Низькі вимоги до введення ДНК при одночасному забезпеченні вищої цільової швидкості порівняно з гібридизаційним захопленням. Сприяє ефективному відкриттю та скринінгу геномних варіантів за допомогою цілеспрямованого підходу.
Амплікони є динамічні структури, які можуть призвести до геномних перебудов, або делеції, дуплікації, або ампліфікації вищого порядку проміжних ділянок ДНК. Амплікони описують внутрішню архітектуру геному, що визначається положенням і орієнтацією його повторюваних послідовностей ДНК.
У молекулярній біології амплікон — це фрагмент ДНК або РНК, який є джерелом та/або продуктом подій ампліфікації або реплікації. Його можна сформувати штучно, використовуючи різні методи в тому числі полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР) або лігазних ланцюгових реакцій (LCR), або природним шляхом через дуплікацію генів.